講述白蓮女高二年五班每個月進行一次秘密投票選出被孤立者，班級裡圍繞著加害者、受害者和旁觀者的學生們漸漸陷入暴力的殘酷生存排名戰爭。

秀智轉學到了白蓮女子高中，第一天就發現2年5班的氣氛不太尋常，旁邊還坐著一個不良學生，幸好還有兩個同學對他很親切，直到當月的最後一個週四，班上同學聚集起來進行金字塔遊戲後，秀智因沒有獲得票數，成為了F等級，因此開始被A等級的人霸凌，受不了被欺負的秀智，開始拉攏坐在隔壁同為F等級的子恩，但沒想到子恩卻不想別人代替自己被霸凌，拒絕和秀智同盟，秀智因此開始尋找誰是背後真正的主導者…

秀智懷疑遊戲的主導者是夏凜，但還是暫時先按兵不動繼續觀察，但霸凌的手法實在越來越過分，秀智打算直接去找夏凜，但途中碰到了藝琳，透過藝琳印證了秀智的推斷，同時也得知夏凜是白蓮集團理事長的女兒，也是創校者的孫女，讓秀智不得不想別的辦法，轉而向導師求助，沒想到導師視錢如命，打算偽造霸凌證據威脅施暴者的家長，幸好被子恩救了下來…

每月一次的投票時間到來了，秀智在第14次遊戲中翻身晉級成為C等級，本以為只要擺脫F就好，對新F智愛不理不睬，因太過現實，讓子恩相當心寒。但秀智發現這一切都逃不過夏凜的掌控，為了避免自己再次成為F，秀智決定聯合子恩和智愛，召集D等級同盟，破壞金字塔遊戲的平衡，因此三人展開一連串的秘密計畫，企圖拉攏D等級的人。

為了得到更多班上同學資訊，秀智將目標放在駭客技術高強的芮媛身上，並派子恩去接觸他，但重新看過芮媛的個人資訊後，發現了不對勁， 秀智拉攏芮媛失敗，自己的計畫也被夏凜得知了，因此打算尋找下一個拉攏對象，首先是海埈，海埈因為怕朋友們等級比自己高，因此將票投給了朋友以外的人，因此秀智拿投票紙條威脅海埈，讓海埈同意幫助他們。秀智和子恩發現勝和偷偷闖入教室，子恩認出他就是友莉的哥哥，秀智因此找他合作，請他幫忙蒐集其他同學的情報。

勝和利用駭客技術查出在馨的秘密，秀智想藉此威脅在馨，但子恩出面接觸並成功拉攏她加入同盟。家長觀摩課時娜熙當面告訴秀智父親2年5班存在校園暴力；同時，夏凜指使承怡演一場自殘戲，引發家長震動。夏凜向家長表示是班上的誤會，他們會自己解決，召開了班會公審，讓秀智失去第15屆遊戲投票權。隨後夏凜向家長展示金字塔遊戲並邀請參與，藝琳表示夏凜向家長公開遊戲也該受罰，因此發起不記名投票，讓夏凜也失去第15屆遊戲投票權。

勝和裝在教室的攝影機被夏凜發現，大家追查真凶時文學老師挺身扛責遭開除。為保護恩貞不成弱點，藝琳選擇與她保持距離。秀智則提出不再用威脅，而是以子恩的方式改變局勢。秀智向承怡道歉、與智愛示好，表示反正沒有F了並提議藉此刪除金字塔遊戲。秀智、子恩、在馨、藝琳正式結盟，展開打破金字塔的行動。首先讓夏凜失去特權，成為普通同學；接著營造子恩曾被背叛的話題博取同情，而子恩的樂於助人也逐漸贏得多數同學的好感。

第三步由藝琳向所有同學提議，若下次金字塔遊戲沒有F的話，就把A的特權也取消。不過夏凜信誓旦旦說下次一定會有F，原來她已動用勢力讓秀智爸爸調職，讓她轉學；並跑去明子恩家，再次拿兩人間的往事威脅，幸好秀智及時出現，不讓子恩被欺負，也表明不轉學了，讓白夏凜相當生氣。全班前往釜山校外教學，每個人內心都有所盤算，有人想找盟友，有人想算帳。

白夏凜威脅在馨，若不聽她的，就讓他哥哥當不成律師；恩貞則選擇犧牲自己，對夏凜唯命是從，讓藝琳陷入為難。夏凜甚至找子恩的母親來，在飯店製造相處融洽的假象。分房時，落單的裕琳加入四人組，子恩試著放下前嫌接納她，表示若非金字塔遊戲，她們或許能成為朋友。當天剛好是秀智生日，四人組為她準備蛋糕，但她仍悶悶不樂。隔天漆彈活動開始，銀星宣布規則，若被打到三發子彈將受嚴厲懲罰，最終受罰的是秀智、子恩、在馨、恩貞與智愛。

秀智、子恩、在馨、智愛互射漆彈鬧成一團。銀星見氛圍不對，便慫恿多妍去阻止他們，結果她與恩貞起衝突，恩貞被木板壓傷，腿部被鐵釘刺穿送醫。班導召集所有學生宣布恩貞被送回首爾徐心醫院動手術。藝琳得知恩貞可能無法再當選手，憤怒撲向多妍，秀智說會讓多妍得到報應，藝琳才停手。回到學校後秀智開始行動，默默探問班上誰願意一起匿名取消金字塔遊戲，並透過校園間流行的社群軟體散布恩貞被打的消息，最終，多妍被迫轉學。

子恩因為恩貞受傷以及夏凜不斷威脅陷入低潮，暫時退出活動。匿名取消金字塔遊戲的計畫已召集了11人，只差2人過半。第16次遊戲開始前，夏凜提議選出固定F。秀智衝進教室質問夏凜，趁機發起投票取消遊戲。子恩率先站起響應，其他人陸續跟進。當只差一人時，多妍為了挑釁白夏凜也跟著起立，但秀智表示她已非班上一員，此票無效。多妍氣到毆打子恩，沒想到這畫面被直播公開到網路上。而此時班長也宣布她刪除了遊戲，人數過半，金字塔遊戲正式被終止。

2年5班校園暴力事件公開後，校方緊急召開家長會，並將5班的同學拆開重新分到其他班，而夏凜也被送去國外讀書；回到正常班級就讀的大家，恢復了平凡的生活。秀智陪子恩到天空之家，夏凜對兩人介紹這裡是她家，而她才是校園暴力的受害者，此時一陣巨響，大火蔓延，夏凜倒在地上。回憶起小學還是紹恩的時候，因成績好而被同學嫉妒，子恩想幫忙說出她是孤兒，但沒想到同學開始霸凌她，子恩則旁觀紹恩被欺負，這裡就是金字塔遊戲的源起。

紹恩為了擺脫最低階級，成功吸引白蓮集團會長注意後被收養，改名白夏凜。高一與子恩重逢，她始終無法原諒子恩，但子恩卻已釋懷，讓夏凜更加憤恨。秀智認為夏凜的仇恨只是為自己行為找藉口。學校買通網友企圖將秀智塑造成加害者，但在學生澄清與崔老師錄影佐證下，她成功洗刷汙名，友莉也勇敢站出來說話。兩個月後，學校由未了集團接手，一切似乎恢復了正常，但未了集團的雙胞胎轉學過來，她們對夏凜發起的金字塔遊戲產生極大興趣。